Skolens viktigste samarbeidsorganer er FAU, Elevrådet, Samarbeidsutvalget og Skolemiljøutvalget.

FAU -  foreldrerådets arbeidsutvalg  - består av en foresatt fra hvert av klassetrinnene på Spetalen. 

FAU oppfordrer til engasjement for skolen vår, og ber dere ellers om å ta kontakt med klassekontaktene og FAU med saker dere har på hjertet. FAU ønsker dere også velkommen til «FAU Spetalen» på Facebook.

SU - Samarbeidsutvalget - er et felles utvalg for virksomheten, med representanter både fra Spetalen skole, SFO og Saltnes barnehage. SU har to foreldrerepresentanter fra skole og to fra barnehagen, to ansatte representanter fra skole/SFO og to fra barnehagen, to representanter fra elevrådet, en politisk valgt representant og virksomhetsleder. Fagansvarlig i barnehagen er sekretær i utvalget. Utvalget har til vanlig ca. fire møter i året.

SMU - Skolemiljøutvalget ved skolen - består av to fra FAU, to elevrådsrepresentanter, politisk representant, representant fra ansatte og virksomhetsleder. Utvalget har sine møter i forkant eller etterkant av SU, og alle fra SMU på Spetalen er også medlemmer i SU.

I elevrådet sitter elever fra 3. til 7. trinn.